魚類的呼吸器官主要是鰓,位於魚的口咽腔兩側,鰓又分為鰓片、鰓絲、鰓小片,這些組成部分的存在,讓鰓與水的接觸面積增大。因此,更容易攝取水中的氧氣。魚的氣體交換是通過鰓小片上的微血管而進行的,氧氣通過微血管進入血液循環,而二氧化碳也通過微血管排出體外。
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