首先，可以通過倉鼠的生殖器官與肛門間的距離進行區分，一般雌性倉鼠的外生殖器與肛門之間距離較近，而雄性倉鼠這兩者之間距離較遠。其次，可以通過倉鼠生殖器形狀進行區分，雄性倉鼠生殖器口呈圓形，而雌性倉鼠的生殖器呈線性。再者，雄性倉鼠的臀部較大、香腺更明顯，而雌性倉鼠剛好相反。
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