物理檢查為看糞便的硬度，一般情況下，正常糞便含60％－70％的水分，病理狀態下，水分吸收減少，因而糞便希軟，甚至呈水樣，反之當腸管運動功能減退或是腸肌遲緩時，糞便硬固，常見於便秘初期。化學檢查為測試糞便的酸鹼度、潛血檢查、蛋白質含量。顯微鏡檢查為看糞便中未消化的食物、寄生蟲卵、腸道菌群等。
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