在素食和肉食的選擇中，邊境牧羊犬是不折不扣的食肉動物，但在野外生活的時候，它們偶爾也會吃些青草和果實等植物。而在主人的調教下，家養的寵物狗與野外生活的狗狗，兩者之間的飲食習慣還是存在很大的差別。家長可以通過從小的培養和訓練，使邊牧犬擁有更為合理，更能讓人接受的飲食習慣。
要訓練邊境牧羊犬的飲食習慣一定要從幼年開始，在狗狗成功斷奶之後就要著手訓練。在正式訓練之前，家長應該為邊牧犬選擇一套合理的飲食方案，制定健康科學的飲食計劃，然後按部就班的培養訓練，在長期的餵養和訓練中，讓邊牧犬養成健康的飲食習慣。
家養的寵物狗，家長一般都會選擇專業的狗糧，新鮮的蔬菜，狗罐頭，狗餅乾等食物進行餵養。此外，在閒暇時間可以選擇一些脂肪含量較少的瘦豬肉、牛肉、羊肉等食物，經過加工製作後給邊牧犬餵食。為了平衡邊境牧羊犬食物的營養，滿足它成長對營養的需求，很多家長都會選擇更多的食物，然後進行合理的搭配，每天定時定量的餵養。在培養狗狗良好的飲食習慣的同時，也可以保證邊牧犬健康的成長。
此外，訓練邊境牧羊犬擁有良好的飲食習慣，除了選擇健康合理的食物餵養之前。家長還應該每天定時、定量、定點的餵養，不要隨便徹底的給它更換食物。而每次需要更換食物的時候，都需要循序漸進，在7-10天的時間左右完成食物更換，讓邊牧犬有足夠的時間去適應新的食物，避免造成腸胃消化負擔，危害到邊境牧羊犬的身體健康。
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